全自動農藥殘留檢測儀檢測前需要通過溶解對果蔬樣品中的農藥殘留物質進行溶解和分離。由于果蔬產品中的農藥使用種類的不同，農藥殘留物質提取溶劑和方法也會有相應的變化。有機溶劑提取效果對于最終農藥殘留檢測結果產生重要影響。合適的溶劑能夠提高農藥殘留檢測結果準確性與測量速度。
全自動農藥殘留檢測儀有機溶劑的選擇要與待測農藥極性相似，提取劑沸點應45～80℃，且不能與樣本發生作用，毒性低，價格便宜，必須能溶解待測農藥。采用ECD時，不能選帶鹵素的溶劑。對含水量高的樣本，一般選與水相混溶的溶劑(乙腈、丙酮等)，要求溶劑對樣本有較強的滲透能力，以便能將樣本中農藥充分提取。
目前我國市售的農藥殘留檢測儀有機溶劑幾乎都需純化后方可使用。
方法：多采用重蒸餾的方法。純化后的溶劑檢驗方法是將溶劑濃縮100倍，吸取1?l注入氣相中無干擾峰即符合要求。也可采用中性氧化鋁、硅膠、活性炭等吸附劑制成層析柱純化。
目前，全自動農藥殘留檢測儀有機溶劑的提取方法大致可以分為以下幾種，它們各有各的特點。超聲法：樣本加入提取劑，以超聲波提取。快速混勻法：適用于液體樣品。振蕩法：在盛有樣本的容器中加提取劑，振蕩一定時間。索氏提取：提取效果好，但時間長，干擾物多。多用于動物樣本。
